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| 產地 | 美國 |
| 品牌 | TAKARA |
| 貨號 | R400492 |
| 用途 | 文庫構建 |
| 包裝規格 | 96 Rxns |
| 純度 | % |
| 是否進口 | 是 |
clontech R400492 ThruPLEX 血漿樣本建庫試劑盒！！！ 買試劑，找華雅，更多生物試劑，就在華雅思創！華雅思創，takara授權代理，品牌供應商，折扣力度大，歡迎咨詢！ 產品名稱：PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 產品貨號：R400492 |
· 單細胞（或＜15 pg DNA）起始，可獲得可重復的結果 · 等位基因再現性 |
| 技術原理： |
| PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 (PicoPLEX WGA v3)可以從單細胞擴增DNA，獲得高度可重復的文庫。細胞裂解和預擴增后，進行低背景的PCR擴增，并在3小時內獲得微克級產物。 除了延續之前PicoPLEX WGA Kit可進行高度可重復的拷貝數變異（CNV）分析外，該試劑盒通過使用高保真酶，盡可能減少擴增誤差，并能檢測單核苷酸變異（SNV）。 |
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| 圖1. PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3技術 |
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| 圖2. 基于PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3的CNV檢測 |
| 以來自不同細胞系(GM22601、GM05067和GM12878)的單細胞起始，使用PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3擴增基因組。之后取1ng的擴增產物，使用Illumina Nextera XT Kit制備文庫，并在Illumina MiSeq（PE 75）進行測序。對Fastq文件去除接頭序列信息后，與human genome assembly GRCh37進行比對。只分析常染色體。對于這兩個panels，校準歸一化至100萬reads，使用bedtools 2.25.0計算每1 Mb的 bin的reads數。使用Integrative Genomics Viewer (IGV)繪制bin counts的log2 ratio (Sample/Reference)。PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3還顯示了可以高品質的進行染色體異倍性分析。 |
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| 圖3. PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3的全基因組覆蓋范圍的重現性高 |
| 以GM12878的單細胞樣本起始（一式兩份），分別使用PicoPLEX WGA v3，A公司試劑盒和B公司試劑盒擴增基因組。之后取1ng的擴增產物，使用Illumina Nextera XT Kit制備文庫，并在MiSeq（PE 75）進行測序。然后與human genome assembly GRCh37進行比對，歸一化至1M reads (0.5M paired-end reads)后，使用bedtools 2.25.0計算每個1 Mb的bin的reads數。對這兩個單細胞文庫的每個窗口的total read進行繪制，計算Pearson和Spearman相關性并在每個圖中標明。 |
| Panel A. 包含異常值的樣本。*由于不同技術存在不同的偏差，沒有排除相關點，所以圖表的比例不同。 Panel B. 排除異常值的樣本。與A公司和B公司試劑盒相比，PicoPLEX WGA v3具有更高的重現性和覆蓋度。 |
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